MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus thermophilus JIM 8232

Total Repeats: 6719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017581	ACT	2	6	1478	1483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017581	CTA	5	15	1576	1590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017581	ATA	2	6	1593	1598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017581	TAA	2	6	1600	1605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017581	T	6	6	2785	2790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017581	AGG	2	6	2795	2800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017581	CTA	2	6	3022	3027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017581	A	6	6	4332	4337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017581	TAAG	2	8	8476	8483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017581	TA	3	6	8488	8493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017581	CTTTT	2	10	8512	8521	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017581	A	8	8	8601	8608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017581	AGA	2	6	8618	8623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017581	GGAAA	2	10	8635	8644	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017581	GAT	2	6	11991	11996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017581	TAA	2	6	12013	12018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017581	TGA	2	6	14608	14613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017581	ATG	2	6	15821	15826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017581	TTCT	2	8	15880	15887	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017581	ATG	2	6	15889	15894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017581	TAGA	2	8	15938	15945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017581	CAGT	2	8	17347	17354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017581	T	6	6	17371	17376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017581	TAA	2	6	17409	17414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017581	A	6	6	17416	17421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017581	TTA	2	6	17422	17427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017581	A	6	6	17427	17432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017581	A	6	6	17447	17452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017581	AAG	2	6	17468	17473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017581	GAT	2	6	17475	17480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017581	GA	3	6	17502	17507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017581	GAA	2	6	17518	17523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017581	A	6	6	17527	17532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017581	A	7	7	17537	17543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017581	AG	3	6	17591	17596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017581	AGA	2	6	17645	17650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017581	GAC	2	6	17686	17691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017581	ATT	2	6	17715	17720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017581	GGC	2	6	17763	17768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017581	AG	3	6	17798	17803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017581	CTT	2	6	17813	17818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017581	ATTT	2	8	17925	17932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017581	TAG	2	6	17980	17985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017581	CGA	2	6	18008	18013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017581	GCA	2	6	18082	18087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017581	CGC	2	6	18129	18134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017581	GTGA	2	8	18135	18142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017581	TGT	2	6	18168	18173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017581	CAG	2	6	18251	18256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017581	AGCG	2	8	18306	18313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017581	AT	3	6	18435	18440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017581	GGA	2	6	18441	18446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017581	CT	3	6	18466	18471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017581	GAA	2	6	18705	18710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017581	GGT	2	6	18779	18784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017581	GTC	2	6	18793	18798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017581	TCGTG	2	10	18802	18811	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017581	CAT	2	6	18861	18866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017581	TAA	2	6	18896	18901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017581	GGA	2	6	18905	18910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017581	ATC	2	6	18929	18934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017581	AC	3	6	18956	18961	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017581	TGGT	2	8	18971	18978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017581	CGC	2	6	19095	19100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017581	AC	3	6	19125	19130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017581	CAC	2	6	19140	19145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017581	AGCC	2	8	19187	19194	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017581	GAT	2	6	19210	19215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017581	CCT	2	6	19266	19271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017581	AGG	2	6	19368	19373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017581	GTAA	2	8	19462	19469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017581	ATAG	2	8	19476	19483	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017581	GTTAA	2	10	19548	19557	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017581	ACG	2	6	19611	19616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017581	TAG	2	6	19782	19787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017581	GCGA	2	8	19790	19797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017581	AGA	2	6	19869	19874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017581	AG	3	6	19897	19902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017581	TCG	2	6	19972	19977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017581	GGA	2	6	19985	19990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017581	CT	3	6	20011	20016	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017581	GGGAG	2	10	20066	20075	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017581	ACA	2	6	20103	20108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017581	ATG	2	6	20170	20175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017581	GGA	2	6	20303	20308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017581	TC	3	6	20389	20394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017581	ACC	2	6	20568	20573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017581	AT	3	6	20589	20594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017581	AGC	2	6	20648	20653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017581	ATTC	2	8	20655	20662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017581	GAA	2	6	20782	20787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017581	GAG	2	6	20798	20803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017581	GA	3	6	20928	20933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017581	ACA	2	6	20954	20959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017581	TA	3	6	20982	20987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017581	CTAA	2	8	21009	21016	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017581	TAG	2	6	21111	21116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017581	GA	3	6	21223	21228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017581	CTGA	2	8	21282	21289	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017581	CT	3	6	21339	21344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017581	GAT	2	6	21357	21362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017581	CGG	2	6	21448	21453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017581	GA	3	6	21546	21551	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017581	TAGG	2	8	21664	21671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017581	GTT	2	6	21708	21713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017581	TAC	2	6	21718	21723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017581	CCT	2	6	21806	21811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_017581	GGT	2	6	21942	21947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017581	TCG	2	6	22057	22062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017581	CGT	2	6	22137	22142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017581	GTT	2	6	22240	22245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017581	AGGGA	2	10	22275	22284	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017581	GA	3	6	22361	22366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017581	GAAGTG	2	12	22386	22397	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017581	ACTAAT	2	12	22416	22427	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017581	AT	3	6	22461	22466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017581	TTGAG	2	10	22509	22518	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017581	GTG	2	6	22732	22737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017581	AT	3	6	22890	22895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017581	A	6	6	22982	22987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017581	ACC	2	6	23095	23100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017581	CGT	2	6	23132	23137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017581	GAG	2	6	23144	23149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017581	TAA	3	9	23240	23248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017581	CTC	2	6	23308	23313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017581	CGC	2	6	23475	23480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017581	TA	3	6	23481	23486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017581	AT	3	6	23570	23575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017581	GGA	2	6	23590	23595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017581	GCGT	2	8	23649	23656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017581	TCC	2	6	23673	23678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017581	AGC	2	6	23699	23704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017581	TCG	2	6	23713	23718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017581	CGG	2	6	23813	23818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017581	TGT	2	6	23842	23847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017581	TGT	2	6	23890	23895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017581	GGT	2	6	24004	24009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017581	TAT	2	6	24121	24126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017581	T	6	6	24157	24162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017581	T	6	6	25567	25572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017581	AGT	2	6	25602	25607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017581	ACA	2	6	27105	27110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017581	TA	3	6	27146	27151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017581	AAT	2	6	27152	27157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017581	AT	3	6	27156	27161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017581	AAT	2	6	27174	27179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017581	A	7	7	27188	27194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017581	ATTT	2	8	27245	27252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017581	TAA	2	6	28639	28644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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